Τελικά δεν προκρίθηκε η πρόταση της Ιατρικής Σχολής Αθηνών να παραμείνει
μονοτμηματική σχολή. Ετσι, στο πλαίσιο των αλλαγών που επιβάλλει ο νέος
νόμος για την τριτοβάθμια εκπαίδευση, η Σύγκλητος του Παν. Αθηνών
αποφάσισε τη λειτουργία Σχολής Επιστημών Υγείας στην οποία εντάχθηκαν η
Ιατρική, το Φαρμακευτικό, η Οδοντιατρική και η Νοσηλευτική. Επίσης, το
τμήμα Μεθοδολογίας, Ιστορίας και Θεωρίας της Επιστήμης εντάχθηκε στη
σχολή Θετικών Επιστημών. Συνολικά, το ΑΕΙ θα έχει έξι σχολές (όπως
τώρα), ενώ αυτόνομο παρέμεινε το Τμήμα Φυσικής Αγωγής και Αθλητισμού.